Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC159P0C7I6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms