Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms