Protein–RNA interactions for Protein: P07316

CRYGB, Gamma-crystallin B, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYGBP07316 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRYGBP07316 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms