Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms