Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTAP01374 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTAP01374 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTAP01374 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTAP01374 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTAP01374 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTAP01374 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTAP01374 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTAP01374 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTAP01374 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTAP01374 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTAP01374 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTAP01374 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTAP01374 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTAP01374 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTAP01374 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTAP01374 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTAP01374 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LTAP01374 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTAP01374 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTAP01374 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms