Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSP01100 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSP01100 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSP01100 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSP01100 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSP01100 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSP01100 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSP01100 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSP01100 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSP01100 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSP01100 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSP01100 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSP01100 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSP01100 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSP01100 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSP01100 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSP01100 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOSP01100 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSP01100 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSP01100 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSP01100 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSP01100 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSP01100 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSP01100 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSP01100 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSP01100 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSP01100 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSP01100 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSP01100 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSP01100 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSP01100 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSP01100 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSP01100 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSP01100 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOSP01100 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOSP01100 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOSP01100 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSP01100 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSP01100 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSP01100 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSP01100 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSP01100 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSP01100 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSP01100 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSP01100 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSP01100 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSP01100 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSP01100 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOSP01100 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms