Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSTAP01040 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSTAP01040 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSTAP01040 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSTAP01040 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSTAP01040 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSTAP01040 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTAP01040 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTAP01040 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTAP01040 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTAP01040 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTAP01040 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTAP01040 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTAP01040 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTAP01040 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTAP01040 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTAP01040 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTAP01040 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTAP01040 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTAP01040 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTAP01040 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTAP01040 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTAP01040 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTAP01040 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTAP01040 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTAP01040 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms