Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYF2O95926 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYF2O95926 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYF2O95926 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYF2O95926 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYF2O95926 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYF2O95926 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYF2O95926 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYF2O95926 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYF2O95926 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYF2O95926 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYF2O95926 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYF2O95926 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SYF2O95926 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYF2O95926 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYF2O95926 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYF2O95926 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYF2O95926 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYF2O95926 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYF2O95926 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYF2O95926 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SYF2O95926 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYF2O95926 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms