Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD1O95696 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD1O95696 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD1O95696 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD1O95696 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD1O95696 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD1O95696 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD1O95696 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD1O95696 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD1O95696 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD1O95696 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD1O95696 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD1O95696 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD1O95696 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD1O95696 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD1O95696 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD1O95696 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD1O95696 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD1O95696 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD1O95696 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD1O95696 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD1O95696 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD1O95696 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD1O95696 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD1O95696 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD1O95696 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD1O95696 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD1O95696 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD1O95696 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD1O95696 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD1O95696 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD1O95696 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD1O95696 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD1O95696 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD1O95696 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD1O95696 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD1O95696 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD1O95696 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD1O95696 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms