Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG12O94817 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG12O94817 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG12O94817 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms