Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEBLO76041 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEBLO76041 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEBLO76041 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEBLO76041 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEBLO76041 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEBLO76041 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEBLO76041 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEBLO76041 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEBLO76041 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEBLO76041 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEBLO76041 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEBLO76041 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEBLO76041 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEBLO76041 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEBLO76041 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEBLO76041 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEBLO76041 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEBLO76041 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEBLO76041 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEBLO76041 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEBLO76041 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEBLO76041 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEBLO76041 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEBLO76041 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEBLO76041 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEBLO76041 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEBLO76041 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEBLO76041 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NEBLO76041 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEBLO76041 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEBLO76041 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEBLO76041 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NEBLO76041 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEBLO76041 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEBLO76041 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEBLO76041 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEBLO76041 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEBLO76041 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEBLO76041 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEBLO76041 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEBLO76041 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEBLO76041 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEBLO76041 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEBLO76041 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEBLO76041 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms