Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCATO75600 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCATO75600 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCATO75600 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCATO75600 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCATO75600 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GCATO75600 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCATO75600 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCATO75600 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCATO75600 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCATO75600 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCATO75600 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCATO75600 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCATO75600 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCATO75600 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCATO75600 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GCATO75600 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCATO75600 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCATO75600 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCATO75600 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCATO75600 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCATO75600 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCATO75600 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCATO75600 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCATO75600 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCATO75600 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCATO75600 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCATO75600 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCATO75600 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms