Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSO75390 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSO75390 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSO75390 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSO75390 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSO75390 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSO75390 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSO75390 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSO75390 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSO75390 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSO75390 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CSO75390 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSO75390 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSO75390 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSO75390 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSO75390 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSO75390 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSO75390 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSO75390 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CSO75390 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSO75390 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSO75390 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSO75390 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSO75390 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSO75390 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSO75390 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSO75390 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSO75390 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSO75390 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSO75390 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSO75390 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSO75390 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSO75390 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSO75390 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSO75390 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSO75390 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSO75390 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSO75390 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSO75390 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSO75390 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSO75390 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CSO75390 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSO75390 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSO75390 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSO75390 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSO75390 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSO75390 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSO75390 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSO75390 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSO75390 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSO75390 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSO75390 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSO75390 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSO75390 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSO75390 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSO75390 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSO75390 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSO75390 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSO75390 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSO75390 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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