Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRAMEF2O60811 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PRAMEF2O60811 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms