Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms