Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCO2O43819 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCO2O43819 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCO2O43819 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCO2O43819 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCO2O43819 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCO2O43819 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCO2O43819 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCO2O43819 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCO2O43819 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCO2O43819 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCO2O43819 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCO2O43819 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCO2O43819 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCO2O43819 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCO2O43819 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCO2O43819 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCO2O43819 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCO2O43819 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCO2O43819 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCO2O43819 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCO2O43819 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms