Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA2O43364 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA2O43364 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA2O43364 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA2O43364 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA2O43364 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms