Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTSS1O43312 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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