Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms