Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms