Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEURL1BA8MQ27 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms