Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms