Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms