Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA3AA6NCI4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms