Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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TCOF1Q13428 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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TCOF1Q13428 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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TCOF1Q13428 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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TCOF1Q13428 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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TCOF1Q13428 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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TCOF1Q13428 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 IL22RA2-203ENST00000349184 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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TCOF1Q13428 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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TCOF1Q13428 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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