Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 BRF2-203ENST00000521170 550 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLCOR22-1-201ENST00000523725 316 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TINF2-210ENST00000559019 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC103810.4-201ENST00000578601 257 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4689-201ENST00000582517 70 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SMIM22-201ENST00000586005 366 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL592211.1-201ENST00000594418 497 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 Z69706.1-201ENST00000595428 547 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SIGLEC21P-201ENST00000598990 1010 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TRMT112P6-201ENST00000599234 372 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AZU1P1-201ENST00000603479 385 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL021918.1-201ENST00000603933 236 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.146-201ENST00000619409 286 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000457.1-201ENST00000620221 378 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SMC1B-202ENST00000404354 3636 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LY9-205ENST00000392203 2213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KRIT1-205ENST00000412043 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP58-202ENST00000381736 4332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR26-201ENST00000284674 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 R3HDM2-205ENST00000403821 3347 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ULBP1-201ENST00000229708 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AOC1-207ENST00000493429 3135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM47A-202ENST00000613251 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP4A11-202ENST00000371904 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP4A22-207ENST00000620131 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC3H7A-201ENST00000355758 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARNT2-201ENST00000303329 6558 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms