Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CHD3-202ENST00000358181 7286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MLYCD-201ENST00000262430 13038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SECISBP2L-209ENST00000559471 7176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 FRMPD4-202ENST00000616992 7916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NOTCH2-201ENST00000256646 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AMOTL1-202ENST00000317829 8844 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NAV2-201ENST00000349880 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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