RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393386.6

PTPRZ1-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 8,175 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-201ENST00000393386 NISCHQ9Y2I1 1504 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYT1Q01538 1121 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRZ1-201ENST00000393386 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRZ1-201ENST00000393386 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRZ1-201ENST00000393386 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRZ1-201ENST00000393386 DCAF8L2P0C7V8 631 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRZ1-201ENST00000393386 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRZ1-201ENST00000393386 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRZ1-201ENST00000393386 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRZ1-201ENST00000393386 ABCC9O60706 1549 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRZ1-201ENST00000393386 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRZ1-201ENST00000393386 NEFLP07196 543 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRZ1-201ENST00000393386 PCGF6Q9BYE7 350 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRZ1-201ENST00000393386 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
PTPRZ1-201ENST00000393386 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRZ1-201ENST00000393386 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRZ1-201ENST00000393386 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRZ1-201ENST00000393386 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRZ1-201ENST00000393386 CECR2Q9BXF3 1484 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRZ1-201ENST00000393386 CHIC1Q5VXU3 224 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRZ1-201ENST00000393386 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRZ1-201ENST00000393386 APLP2Q06481 763 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYO15BQ96JP2 1530 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRZ1-201ENST00000393386 DNAJC5BQ9UF47 199 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRZ1-201ENST00000393386 HRCP23327 699 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRZ1-201ENST00000393386 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRZ1-201ENST00000393386 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRZ1-201ENST00000393386 SCRIBQ14160 1630 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRZ1-201ENST00000393386 NACADO15069 1562 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRZ1-201ENST00000393386 MROH2BQ7Z745 1585 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRZ1-201ENST00000393386 EHMT2Q96KQ7 1210 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRZ1-201ENST00000393386 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRZ1-201ENST00000393386 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRZ1-201ENST00000393386 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRZ1-201ENST00000393386 CLSPNQ9HAW4 1339 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRZ1-201ENST00000393386 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRZ1-201ENST00000393386 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRZ1-201ENST00000393386 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRZ1-201ENST00000393386 BICRAQ9NZM4 1560 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRZ1-201ENST00000393386 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRZ1-201ENST00000393386 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRZ1-201ENST00000393386 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRIM41Q8WV44 630 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRZ1-201ENST00000393386 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRZ1-201ENST00000393386 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRZ1-201ENST00000393386 BCL11AQ9H165 835 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRZ1-201ENST00000393386 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
PTPRZ1-201ENST00000393386 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRZ1-201ENST00000393386 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRZ1-201ENST00000393386 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRZ1-201ENST00000393386 NCAPD3P42695 1498 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRZ1-201ENST00000393386 NBR1Q14596 966 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRZ1-201ENST00000393386 BCANQ96GW7 911 aa7.65□□□□□ -1.19
PTPRZ1-201ENST00000393386 SLC24A1O60721 1099 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRZ1-201ENST00000393386 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRZ1-201ENST00000393386 SOGA1O94964 1423 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRZ1-201ENST00000393386 CSRNP3Q8WYN3 585 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRZ1-201ENST00000393386 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRZ1-201ENST00000393386 WIZO95785 1651 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 SMARCA4P51532 1647 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 ANP32CO43423 234 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 SMARCA2P51531 1590 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 NESP48681 1621 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 ABCC8Q09428 1581 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 CFTRP13569 1480 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 FKBP8Q14318 412 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 PEG3Q9GZU2 1588 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARXQ96QS3 562 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 IGF1RP08069 1367 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 PTMSP20962 102 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms