Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
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R3HDM1Q15032 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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R3HDM1Q15032 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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R3HDM1Q15032 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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R3HDM1Q15032 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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R3HDM1Q15032 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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R3HDM1Q15032 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
R3HDM1Q15032 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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