Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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TRAF1Q13077 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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TRAF1Q13077 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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TRAF1Q13077 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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TRAF1Q13077 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TRAF1Q13077 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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