Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX4Q06945 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms