Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 SDK2-201ENST00000392650 10723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 CPM-201ENST00000338356 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 SCAF11-202ENST00000369367 7543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MAP1A-202ENST00000382031 10553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 LCORL-207ENST00000635767 10430 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC008655.2-201ENST00000597049 304 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 SIM1-202ENST00000369208 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 VWA5A-205ENST00000456829 4388 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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PKHD1P08F94 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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PKHD1P08F94 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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PKHD1P08F94 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 KIAA1217-207ENST00000396445 5706 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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PKHD1P08F94 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 CHIC1-202ENST00000373504 6797 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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PKHD1P08F94 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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PKHD1P08F94 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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PKHD1P08F94 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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PKHD1P08F94 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 FAM13A-201ENST00000264344 5858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 OR1D2-203ENST00000641833 4887 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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PKHD1P08F94 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ABHD2-201ENST00000352732 8735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MARF1-202ENST00000540441 7105 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AHCTF1-202ENST00000366508 8751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MTOR-201ENST00000361445 8677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ZBTB40-204ENST00000404138 8992 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 TNC-210ENST00000535648 7508 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AL590065.1-201ENST00000603371 4774 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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