Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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