Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 304 ms