Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA13-204ENST00000399949 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC7A8-204ENST00000422941 3018 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MRS2-203ENST00000378386 3313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TDP1-202ENST00000393452 2370 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA8B-202ENST00000438958 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KIR3DX1-205ENST00000610811 3325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARL13B-201ENST00000303097 3264 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR59-223ENST00000616369 1953 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PIWIL2-205ENST00000611073 2864 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNE1-203ENST00000354674 3154 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR33-204ENST00000409658 3104 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ALOXE3-202ENST00000380149 3362 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DCAF5-208ENST00000556847 2791 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KPNA5-201ENST00000356348 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090136.3-201ENST00000520834 2704 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGA6-207ENST00000458358 3261 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CST2-201ENST00000304725 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L13-201ENST00000317582 2992 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 S100A2-201ENST00000368707 556 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPV5-203ENST00000442623 2120 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL358613.1-201ENST00000444965 442 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL390726.1-201ENST00000451357 202 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FXYD4-201ENST00000476166 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms