Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
R4GMQ9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
R4GMQ9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
R4GMQ9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
R4GMQ9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
R4GMQ9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
R4GMQ9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
R4GMQ9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
R4GMQ9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
R4GMQ9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
R4GMQ9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
R4GMQ9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
R4GMQ9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
R4GMQ9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
R4GMQ9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
R4GMQ9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
R4GMQ9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
R4GMQ9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms