Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms