Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms