Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD2APQ9Y5K6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms