Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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HCN4Q9Y3Q4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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HCN4Q9Y3Q4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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HCN4Q9Y3Q4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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HCN4Q9Y3Q4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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HCN4Q9Y3Q4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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HCN4Q9Y3Q4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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HCN4Q9Y3Q4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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HCN4Q9Y3Q4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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