Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL11Q9Y3B7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms