Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms