Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms