Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAK1Q9UPV9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAK1Q9UPV9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms