Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA2Q9UL42 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms