Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms