Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms