Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms