Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms