Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRP68Q9UHB9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms